Molecular Epidemiology of Hepatitis C virus in Prishtina region of Kosovo [Molekularna epidemiologija virusa Hepatitisa C u regiji Priština na Kosovu]

Jakupi, Xhevat (2018) Molecular Epidemiology of Hepatitis C virus in Prishtina region of Kosovo [Molekularna epidemiologija virusa Hepatitisa C u regiji Priština na Kosovu]. PhD thesis, Sveučilište u Zagrebu.

PDF Download (4MB)

Abstract

Aim: To determine genetic diversity of HCV among different population groups in Prishtina, Kosovo. Methods: Anti-HCV positive samples of dialysis patients, IDUs, blood donors, and chronic HCV patients were HCV genotyped and sequenced. To better understand the underlying conditions of HCV infection, interviews were used with all groups. Results: Anti-HCV positive findings were observed in 22% of dialysis patients in Prishtina, and as average among 53% of patients at dialysis centers of Kosovo, as well as in 48% of IDUs. HCV subtype 1a was most prevalent among dialysis patients in Prishtina (47%) and overall in Kosovo (62%), and among IDUs (64%), whereas genotype 1b was most prevalent among chronic HCV patients (42%) and blood donors (67%). The second most prevalent genotypes were 3a among IDUs (34%) and 4d among dialysis patients in Prishtina (44%) and overall at dialysis centers of Kosovo (33%). Phylogenetic trees of HCV subtypes 1a, 1b, 3a, and 4d showed phylogenetic clusters of samples related to dialysis centers or drug use. Duration of dialysis and receiving dialysis in different centers were factors associated with anti-HCV positivity among Kosovo dialysis patients, whereas specifically for Prishtina, in addition to the above, those factors included blood transfusion, age and knowledge about HCV among dialysis patients, while among IDUs those were age, duration of drug injection, lower educational level, drug injection in shooting galleries, and being in prison. Conclusion: High levels of HCV infection at dialysis center in Prishtina and overall at Kosovo dialysis centers and among IDUs are present in Kosovo, with HCV subtype 1a being most prevalent. This situation reiterates the need for strict adherence to infection control practices at dialysis centers and implementation of harm reduction activities among IDUs.

Abstract in Croatian

Cilj: Utvrditi genetsku raznolikost HCV-a među različitim skupinama populacije u Prištini, na Kosovu. Metode: Učinjena je genotipizacija i sekvenciranje HCV-a na anti-HCV pozitivnim uzorcima krvi bolesnika na hemodijalizi, korisnicima droga injektiranjem, darivatelja krvi i kroničnih pacijenata zaraženih virusom hepatitisa C. Za bolje razumijevanje čimbenika povezanih s HCV infekcijom, korišteni su intervjui kod svih ispitivanih skupina. Rezultati: Pozitivni anti-HCV nalazi dobiveni su kod 22% bolesnika na hemodijalizi u Prištini, kao prosjek u 53% bolesnika u centrima za hemodijalizu na Kosovu, kao i kod 48% korisnika droga injektiranjem. HCV genotip 1a bio je najzastupljeniji kod bolesnika na hemodijalizi u Prištini (47%) i sveukupno na Kosovu (62%) te među korisnicima droga injektiranjem (64%), dok je genotip 1b bio najzastupljeniji među kroničnim bolesnicima zaraženim virusom hepatitisa C (42%) i darivateljima krvi (67%). Drugi po redu najzastupljeniji genotipovi bili su 3a među korisnicima droga injektiranjem (34%) te 4d među bolesnicima na hemodijalizi u Prištini (44%) te sveukupno u centrima za hemodijalizu na Kosovu (33%). Filogenetska stabla HCV genotipova 1a, 1b, 3a i 4d pokazala su filogenetsko grupiranje uzoraka u klastere s obzirom na centre za hemodijalizu i korištenje droga. Dužina perioda na hemodijalizi i dobivanje hemodijalize u različitim centrima uočeni su kao čimbenici koji su povezani s anti-HCV pozitivnim nalazima među bolesnicima na hemodijalizi na Kosovu, dok su specifično za Prištinu, pored već spomenutih, ti čimbenici uključivali i transfuziju krvi, dob i znanje o HCV-u među bolesnicima na hemodijalizi, a među korisnicima droga injektiranjem to su bili dob, trajanje korištenja droga ubrizgivanjem, niža razina obrazovanja, ubrizgavanje droga u nadziranim prostorima (tzv. 'shooting galleries') te boravak u zatvoru. Zaključak: Na Kosovu postoji visoka razina HCV infekcija u centru za hemodijalizu u Prištini i općenito u centrima za hemodijalizu na Kosovu te kod korisnika droga injektiranjem, a najzastupljeniji je HCV genotip 1a. Zbog ovakve situacije ponovno se naglašava potreba za strogim pridržavanjem mjera za suzbijanje HCV infekcije u centrima za hemodijalizu te provedbu aktivnosti za smanjivanje štete kod korisnika droga injektiranjem.

Actions (login required)

View Item

Downloads